<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">nmp</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Журнал им. Н.В. Склифосовского «Неотложная медицинская помощь»</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Russian Sklifosovsky Journal "Emergency Medical Care"</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2223-9022</issn><issn pub-type="epub">2541-8017</issn><publisher><publisher-name>“N.V. Sklifosovsky Research Institute for Emergency Medicine”</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.23934/2223-9022-2020-9-3-422-426</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">nmp-952</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЕ СООБЩЕНИЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PRELIMINARY REPORT</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Роль умеренных и вирулентных эндогенных бактериофагов в лечении гнойно-воспалительных инфекций у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>The Role of Moderate and Virulent Endogenous Bacteriophages in the Treatment of Pyoinflammatory Infections in Intensive Care Unit Patients</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3402-7845</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Лазарева</surname><given-names>Е. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Lazareva</surname><given-names>E. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Лазарева Елена Борисовна доктор медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории клинической микробиологии</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena B. Lazareva Doctor of Medical Sciences, Senior Researcher, Laboratory of Clinical Microbiology</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><email xlink:type="simple">ellaz@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6167-7117</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Черненькая</surname><given-names>Т. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chernenkaya</surname><given-names>T. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Черненькая Татьяна Витальевна кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией клинической микробиологии</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Tatiana V. Chernenkaya Candidate of Medical Sciences, Head of the Laboratory of Clinical Microbiology Laboratory</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3417-2682</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шабанов</surname><given-names>А. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shabanov</surname><given-names>A. K.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Шабанов Аслан Курбанович доктор медицинских наук, заместитель главного врача по анестезиологии и реаниматологии</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Aslan K. Shabanov Doctor of Medical Sciences, Deputy Chief for Anesthesiology and Resuscitation</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><email xlink:type="simple">aslan_s@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Евдокимова</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yevdokimova</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Евдокимова Наталья Витальевна кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клинической микробиологии</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Natalya V. Yevdokimova Candidate of Sciences in Biology, Senior Researcher, Laboratory of Clinical Microbiology</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><email xlink:type="simple">env1111@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Жиленков</surname><given-names>Е. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zhilenkov</surname><given-names>E. L.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Жиленков Евгений Леонидович кандидат биологических наук, заместитель генерального директора</p><p>142380, Московская область, Чеховский район, пос. Любучаны, ул. Научная, д. 1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Evgeny L. Zhilenkov Candidate of biological sciences, Deputy General Director</p><p>1 Nauchnaya St., Moscow region, Chekhov District, posyolok Lyubuchany 142380</p></bio><email xlink:type="simple">zhilenkoevgeny@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9612-6705</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Годков</surname><given-names>М. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Godkov</surname><given-names>M. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Годков Михаил Андреевич доктор медицинских наук, профессор, заведующий научным отделом лабораторной диагностики</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Mikhail A. Godkov Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Scientific Department of Laboratory Diagnostics</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3292-8789</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Петриков</surname><given-names>С. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Petrikov</surname><given-names>S. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Петриков Сергей Сергеевич доктор медицинских наук, член-корреспондент РАН, директор</p><p>129090, Москва, Б. Сухаревская пл., д. 3</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sergey S. Petrikov Doctor of Medical Sciences, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Director</p><p>3 B. Sukharevskaya Sq., Moscow 129090</p></bio><email xlink:type="simple">petrikovss@sklif.mos.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">ГБУЗ «Научно-исследовательский институт скорой помощи им. Н.В. Склифосовского ДЗМ»<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">N.V. Sklifosovsky Research Institute for Emergency Medicine of the Moscow Health Department<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru">ООО НПЦ «МикроМир»<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">SPC MicroMir<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>22</day><month>10</month><year>2020</year></pub-date><volume>9</volume><issue>3</issue><fpage>422</fpage><lpage>426</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Лазарева Е.Б., Черненькая Т.В., Шабанов А.К., Евдокимова Н.В., Жиленков Е.Л., Годков М.А., Петриков С.С., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Лазарева Е.Б., Черненькая Т.В., Шабанов А.К., Евдокимова Н.В., Жиленков Е.Л., Годков М.А., Петриков С.С.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Lazareva E.B., Chernenkaya T.V., Shabanov A.K., Yevdokimova N.V., Zhilenkov E.L., Godkov M.A., Petrikov S.S.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.jnmp.ru/jour/article/view/952">https://www.jnmp.ru/jour/article/view/952</self-uri><abstract><sec><title>Введение</title><p>Введение. В связи с развитием устойчивости возбудителей гнойно-воспалительных инфекций (ГВИ) к антибиотикам к лечению стали подключать бактериофаги, которые широко распространены в природе там, где есть гомологичные к ним бактерии. Они находятся и в организме человека, возможно, защищая от ГВИ. Установлено, что летальность у пациентов, имевших бактериофаги, была ниже, чем у пациентов без гомологичных эндогенных бактериофагов. Наиболее часто в биоматериалах (и в моче, и в крови) встречались умеренные бактериофаги, которые «защищали» пациентов от инфекции, несмотря на то, что считается, что эта роль присуща только вирулентным бактериофагам.</p></sec><sec><title>Цель работы</title><p>Цель работы. Изучение влияния вирулентных и умеренных эндогенных бактериофагов на течение гнойно-воспалительных инфекций у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ).</p></sec><sec><title>Материал и методы</title><p>Материал и методы. В исследование включены 33 пациента, находившиеся на лечении в ОРИТ, с положительной гемокультурой. Из них у 12 (36,4%) были выявлены эндогенные бактериофаги (мужчин — 10, женщин — 2). Из образцов выделено 16 гемокультур различных бактерий.Бактериологическое исследование крови проводили с помощью автоматического анализатора гемокультур Bactec-9050. Идентификацию выделенных микроорганизмов выполняли с использованием автоматического микробиологического анализатора WalkAway 40. Работу с бактериофагами выполняли традиционными вирусологическими методами на базе ООО НПЦ «МикроМир» .</p></sec><sec><title>Результаты и обсуждение</title><p>Результаты и обсуждение. Из 16 положительных гемокультур выделены: Klebsella pneumoniaе — в 7 пробах, Acinetobacter spр.— в 4, Staphylococcus spр. — в 2 и по одному штамму в каждой пробе: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus и Enterococcus faecalis.У 12 пациентов (36,4%) были выделены эндогенные фаги, которые были обнаружены ко всем гемокультурам. Исключение составили штаммы K. pneumoniaе, у которых в 42,9% наблюдений (3 случая из 7) бактериофаги отсутствовали.Из 14 проб крови выделено 11 умеренных бактериофагов, что составило 78,6%, вирулентных 21,4%. Несмотря на это, отмечено защитное действие бактериофагов.</p></sec><sec><title>Выводы</title><p>Выводы:</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Abstract</title><p>Abstract. In connection with the growth of resistance of pathogens of pyoinflammatory infections (PII) to antibiotics, physicians began to use bacteriophages, which are widespread where there are homologous bacteria. They are also found in the human body, possibly protecting against PII. It was found that mortality in patients with bacteriophages was lower than in patients without homologous endogenous bacteriophages. The most common were mild bacteriophages, which “protected” patients from infection, although it is believed that only virulent bacteriophages may do this.</p></sec><sec><title>Aim of study</title><p>Aim of study. To study the effect of virulent and moderate endogenous bacteriophages on the course of pyoinflammatory infections in intensive care units (ICU) patients.</p></sec><sec><title>Material and methods</title><p>Material and methods. The study included 33 patients with positive blood culture who were treated in the ICU. Of these, 12 (36.4%) had endogenous bacteriophages (10 men, 2 women).We isolated 16 strains of various bacteria. Bacteriological blood tests were performed using an automatic blood culture analyzer Bactec-9050. Identification of isolated microorganisms was carried out using an automatic microbiological analyzer WalkAway 40. Traditional virological methods on the basis of LLC SPC MicroMir were used for work with bacteriophages.</p></sec><sec><title>Results and discussion</title><p>Results and discussion. From 16 positive blood cultures, the following were isolated: Klebsiella pneumoniaе — in 7 samples, Acinetobacter spр. — in 4 samples, Staphylococcus spp. — in 2 samples, and one strain in each sample: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus and Enterococcus faecalis. Endogenous phages were isolated in 36.4% of patients, which were detected in all blood cultures. The exception was K. pneumoniae strains, for which in 42.9% of cases (3 cases out of 7) bacteriophages were absent.Out of 12 patients with isolated bacteriophages, 6 had positive treatment outcomes.Of 14 blood samples, 11 moderate bacteriophages were isolated, which amounted to 78.6%, virulent — 21.4%. Despite this, the protective effect of bacteriophages was noted.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. 1. All blood cultures contained homologous bacteriophages, except K. pneumoniaе strains, which had no endogenous bacteriophages in 42.9% of cases. 2. Most of the isolated endogenous bacteriophages (78.6%) were moderate. 3. In the absence of homologous bacteriophages in the blood of ICU patients, the likelihood of death increases (66.7%) compared to patients with bacteriophages (33.3%).</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>эндогенные бактериофаги</kwd><kwd>микрофлора</kwd><kwd>тяжелая сочетанная травма</kwd><kwd>ОРИТ</kwd><kwd>лечение</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>endogenous bacteriophages</kwd><kwd>microbiota</kwd><kwd>severe concomitant injury</kwd><kwd>ICU patients</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лазарева Е.Б., Меньшикова Е.Д., Евдокимова Н.В., Черненькая Т.В., Спиридонова Т.Г., Жиркова Е.А., и др. Частота обнаружения вирулентных и умеренных эндогенных бактериофагов у больных с термической травмой. Медицинский алфавит. 2018;28(365). Сер.: Неотложная медицина. 2018; 3:55-58.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lazareva EB, Menshikova ED, Evdokimova NV, Chernenkaya TV, Spiridonova TG, Zhirkova EA, et al. Frequency of virulent and moderate endogenous bacteriophage detection in patients with thermal trauma. Medical alphabet. 2018;(28):55–58. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лазарева Е.Б., Черненькая Т.В., Шабанов А.К., Евдокимова Н.В., Жиленков Е.Л., Петриков С.С. Выявление эндогенных бактериофагов у реанимационных больных при бактериемии и сепсисе. В кн.: Бактериофаги. Теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности (к 70-летию профессора В.А. Алешкина): материалы Четвертой науч.практ. конф. с междунар. уч., (Нижний Новгород, 24–26 сентября 2018 г.). Москва; 2018. с. 49–50. URL: http://www.congress-phages.ru/_pictures/2018/Tezisy_1.pdf [Дата обращения 10 октября 2019 г.]</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lazareva EB, Chernen’kaya TV, Shabanov AK, Evdokimova NV, Zhilenkov EL, Petrikov SS. Vyyavlenie endogennykh bakteriofagov u reanimatsionnykh bol’nykh pri bakteriemii i sepsise. In: Bakteriofagi. Teoreticheskie i prakticheskie aspekty primeneniya v meditsine, veterinarii i pishchevoy promyshlennosti (k 70-letiyu professora V.A. Aleshkina): materialy Chetvertoy nauch.-prakt. konf. s mezhdunar. uch., (Nizhniy Novgorod, 24–26 sentyabrya 2018 g.). Moscow; 2018. pp.49–50. Available at: http://www.congress-phages.ru/_pictures/2018/Tezisy_1.pdf [Accessed Oct 10, 2019] (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Petrikov SS, Shabanov AK, Chernenkaya TV, Lazareva EB, Evdokimova NV, Zhilenkov E, et al. Identification of endogenous bacteriophages in patients with bacteremia and sepsis – an observational study. Intensive Care Medicine Experimental. 2018;6(1: Sepsis-2018: abstr. of meeting (Bangkok, Thailand, 1–3 October 2018):20. Abstr. P33).</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Petrikov SS, Shabanov AK, Chernenkaya TV, Lazareva EB, Evdokimova NV, Zhilenkov E, et al. Identification of endogenous bacteriophages in patients with bacteremia and sepsis - an observational study. Intensive Care Medicine Experimental. 2018; 6(1: Sepsis–2018: abstr. of meeting (Bangkok, Thailand, October 1–3, 2018):20. Abstr. P33).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTICA. Москва: Медиа Сфера; 2003.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rebrova OYu. Statisticheskiy analiz meditsinskikh dannykh. Primenenie paketa prikladnykh programm STATISTICA. Moscow: Media Sfera Publ.; 2003. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Руднов В.А., Бельский Д.В., Дехнич А.В. Инфекции в ОРИТ России: результаты национального многоцентрового исследования. Клиническая микробиология и антибактериальная терапия. 2011;13(4):294–303.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rudnov VА, Belsky DV, Dekhnich АV, Matveev AS, Yarustovsky MB. Infections in Russian ICUS: Results of the Nationwide Multicenter Study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2011;13(4):294–303. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Каттер Э., Сулаквелидзе А. (ред.) Бактериофаги. Биология и практическое применение. Москва: Научный мир; 2012.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">E. Kutter and A. Sulakvelidze (eds.), Bacteriophages: biology and applications. CRC Press, Boca Raton, 2005. (Russ. ed.: Katter E., Sulakvelidze A. (eds.) Bakteriofagi. Biologiya i prakticheskoe primenenie. Moscow: Nauchnyy mir Publ.; 2012.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Górski A, Weber-Dabrowska B. The potential role of endogenous bacteriophages in controlling invading pathogens. Cell Mol Life Sci. 2005;62(5):511–519. PMID: 15747058 https://doi.org/10.1007/s00018004-4403-6</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Górski A, Weber-Dabrowska B. The potential role of endogenous bacteriophages in controlling invading pathogens. Cell Mol Life Sci. 2005;62(5):511–519. PMID: 15747058 https://doi.org/10.1007/s00018004-4403-6</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
